Super Science High School(SSH)事業は、未来を担う科学技術系人材を育成するために、先進的な理数系教育を実施する高等学校などを指定し、支援する国の取り組みです。本校は、平成19年-23年度より初めて5年間の指定を受け、さらに、平成24-28年度までは併設する日高高等学校附属中学校も含めた中高一貫教育校として2期目となる指定を受けました。
和歌山の豊かな自然や地域性、大学・研究機関・海外姉妹校との連携を活かした探究的な学習活動を積極的に推進し、学校教育目標である「高いレベルの探求心」や「論理的な思考力」の育成を図るとともに、総合科学科における中高一貫した理数教育のありかたを構築する。また、これらのプログラムを活かし、国際人育成にむけた研究開発を行う。